과학자들은 남아프리카, 홍콩, 유럽에서 COVID-19를 유발하는 바이러스인 SARS-CoV-2의 새로운 변종 사례를 발견했습니다. Omicron(B.1.1.529)은 바이러스가 숙주 세포를 감염시키는 데 사용하는 스파이크 단백질의 핵심 부분을 암호화하는 게놈 부분에 전례 없이 많은 수의 돌연변이를 가지고 있습니다. 이것은 Omicron이 백신이 제공하는 면역 보호의 일부를 피할 수 있음을 시사하며, 그 중 많은 부분이 원래 스파이크 단백질과 과거 감염을 기반으로 합니다.
2021년 11월 16일에 남아프리카 공화국의 COVID-19 일일 기록 사례는 136건이었습니다. 2021년 11월 25일까지 그 숫자는 1,200개 이상으로 증가했습니다.
이 사례의 80% 이상이 요하네스버그와 프리토리아를 포함하는 인구 밀도가 높은 가우텡 지방에서 발생했습니다.
연구원들은 각 감염으로 인한 평균 신규 사례 수인 R-값이 남아프리카 공화국 전체에서 1.47인 것으로 추정했습니다.
R이 1보다 크면 발병이 기하급수적으로 증가합니다. Gauteng 지방에서 R은 1.93이었습니다.
남아프리카 스텔렌보쉬에 있는 전염병 대응 및 혁신 센터(CERI)의 과학자들은 오미크론(B.1.1.529)으로 알려진 새로운 변종 바이러스가 이러한 걱정스러운 수치에 책임이 있다고 믿고 있습니다.
대유행 기간 동안 남아프리카에서 이전에 세 번의 감염 정점이 있었으며 세 번째는 델타 변종으로 인한 것입니다. 최근 급증은 과학자들이 처음으로 오미크론을 감지한 것과 일치합니다.
과학자들은 남아프리카에서 확인된 약 100건의 오미크론 감염 사례의 염기서열을 분석했습니다. 대부분의 사례는 Gauteng에서 발생했습니다.
새로운 변종은 보츠와나와 홍콩에도 존재하며 과학자들은 유럽에서도 이를 확인했습니다.
남아프리카 공화국에서 뉴스 브리핑
2021년 11월 25일 가상 뉴스 브리핑에서 CERI의 책임자인 Tulio de Oliveira 교수는 “오늘의 주요 메시지는 싸우려면 적을 알아야 한다는 것입니다.”라고 말했습니다.
그는 변이체의 게놈이 “매우 특이한 돌연변이 배열”을 포함하고 있다고 말했습니다. 이들 중 다수는 바이러스가 면역 체계를 회피하거나 전염성을 높이는 데 도움이 되는 것으로 확인되거나 예측됩니다.
그는 바이러스의 전체 게놈에 걸쳐 약 50개의 돌연변이가 있으며 스파이크를 코딩하는 부분에는 30개 이상의 돌연변이가 있다고 말했습니다. 이것은 바이러스가 숙주 세포를 침범하도록 하는 단백질입니다.
수용체 결합 도메인(RBD)이라고 하는 스파이크의 특정 부분은
올리베이라 교수는 새로운 변종의 RBD 내에서 예외적으로 많은 변화가 있다고 말했다.
RBD에 결합하는 항체는 바이러스가 세포를 감염시키는 것을 방지할 수 있습니다. 따라서 RBD는 특정 단백질 서열에 대한 항체를 만들도록 면역 체계를 유발하는 COVID-19 백신의 중요한 표적입니다.
올리베이라 교수는 베타 변이체는 게놈의 RBD 부분에 3개의 돌연변이를 갖고 있고 델타 변이체는 2개를 갖고 있다고 말했다. 그러나 유럽 질병 예방 및 통제 센터(European Center for Disease Prevention and Control)에 따르면 오미크론에는 15개의 돌연변이가 있습니다.
과학자들의 우려는 돌연변이로 인한 변화가 백신 접종을 통해 생성되거나 감염 중 바이러스의 오래된 변종과의 만남을 통해 생성되는 항체가 바이러스를 중화시키는 것을 막을 수 있다는 것입니다.
치료 항체
아프리카 보건 및 인구 연구 센터(Africa Center for Health and Population Studies)의 전염병 전문가인 Dr. Richard Lessells는 뉴스 브리핑에서 Omicron의 게놈이 항체를 중화시키는 저항성과 관련된 여러 돌연변이를 가지고 있다고 말했습니다.
여기에는 백신 접종이나 자연 감염을 통해 생성된 항체뿐만 아니라 치료용 단일 클론 항체도 포함됩니다.
Lessells 박사는 Omicron 게놈이 또한 숙주 세포로의 보다 효율적인 진입 및 향상된 전달성과 관련된 돌연변이 클러스터를 가지고 있다고 말했습니다.
또한, 선천성 면역 체계로 알려진 새로 발생하는 병원체에 대한 신체의 첫 번째 방어선에 대한 내성과 관련된 돌연변이가 있습니다.
“이 모든 것들이 우리에게 이 변이체가 더 효율적으로 퍼질 수 있도록 전염성을 향상시켰을 뿐만 아니라 면역 체계의 일부와 면역 체계에 있는 보호 기능을 우회할 수 있을지도 모른다는 우려를 불러일으키고 있습니다.” 그는 말했다.
그러나 그는 돌연변이의 결합 효과는 알려지지 않았다고 강조했다. Omicron이 이전 변종보다 더 가벼운 증상을 유발할 가능성도 있습니다.
“우리는 실험실에서 연구를 해야만 진짜로 알게 될 것입니다. […]. [T]모자 작업은 이미 진행 중”이라고 덧붙였다.
“우리는 돌연변이의 영향에 대해 몇 가지 예측을 할 수 있지만 완전한 의미는 여전히 불확실하며 백신은 여전히 우리를 보호하는 중요한 도구입니다.”
– Tulio de Oliveira 교수, Ph.D.
우려의 변형
2021년 11월 26일,
앞으로 며칠 동안 전 세계 여러 국가에서 남아프리카 국가에서 돌아오는 여행자에게 추가 제한을 가했습니다.
과학자들은 이후 유럽에서 오미크론 변이체에 감염된 여러 사례를 확인했습니다.
뉴욕 시 컬럼비아 대학의 바이러스학자인 Dr. Daniel Griffin은 이렇게 말했습니다. 오늘의 의료 뉴스 SARS-CoV-2의 이전 변종에 비해 Omicron 변이체의 변화 수가 매우 높다는 점입니다.
그는 새로운 변이체가 면역 체계가 손상된 백신 접종을 받지 않은 개인에게서 진화했을 수 있다고 추측합니다. 이것은 바이러스가 인간 면역 체계에 적응하는 데 비정상적으로 오랜 시간을 주었을 것입니다.
Griffin 박사는 “이 변종이 현재 설명되고 있다는 사실은 놀라운 일이 아닙니다. 우리는 백신 접종률이 낮은 전 세계적으로 계속해서 바이러스에 수백만 번의 복제 기회를 제공하고 더 적합한 변이체를 선택할 수 있기 때문입니다.”라고 말했습니다. .
“현재 이 바이러스에 대한 데이터는 제한적이지만 스파이크 단백질 변화 중 일부를 볼 수 있으며 이 바이러스에 대해 알고 있는 바에 따르면 면역 회피와 이 변이체가 대체할 가능성에 대해 우려하는 것이 매우 적절합니다. 델타 변종”이라고 덧붙였다.
앞으로 몇 주 동안 과학자들이 답해야 할 중요한 질문은 다음과 같습니다.
- 다른 백신이 이 변이체에 대해 얼마나 잘 작동합니까?
- 재감염율에 미치는 영향은 무엇입니까?
- 오미크론은 이미 널리 퍼졌나요?
- Delta 변형과 비교하여 Omicron의 상대적 적합성은 무엇입니까?
향상된 투과율
COVID-19 Genomics UK Consortium의 이사이자 영국 케임브리지 대학교의 공중 보건 및 미생물학 교수인 Sharon Peacock은 런던의 Science Media Center에 Omicron의 몇 가지 변화가 향상된 전염성과 일치한다고 말했습니다.
“면역 회피와 관련된 다른 변이체와 관련된 돌연변이도 존재합니다.”라고 그녀는 설명했습니다.
“그러나 감지된 많은 돌연변이의 중요성과 이러한 돌연변이의 조합은 알려져 있지 않습니다.”
그녀는 현재 백신이 오마이크론에 대해 얼마나 많은 보호를 제공할 것인지에 대한 데이터가 현재 없다고 강조했습니다.
그녀는 “그동안 백신 접종은 계속 진행되어야 한다”고 결론지었다.
