- 오미크론은 현재
지배적 인 변종 SARS-CoV-2의 전 세계. - 그것은 많은 국가에서 대규모 추가 예방 접종 프로그램을 촉발시킨 감염 및 예방 접종에 대한 이전 면역을 피할 수 있습니다.
- 면역을 회피하는 능력은 항체 결합을 방해하는 스파이크 단백질에서 발생하는 돌연변이 때문입니다.
코로나19를 유발하는 바이러스인 SARS-CoV-2에 대한 백신이 개발된 이후로, 바이러스가 면역을 회피하는 방향으로 변이할 것이라는 우려가 있어왔다.
물론 발견과 함께
그것이 면역을 회피할 수 있다는 발견은 변이의 게놈을 시퀀싱하여 이것이 어떻게 할 수 있는지 정확히 지적하기 위해 서두르게 했습니다.
컬럼비아 미주리 대학과 네브래스카 대학의 한 연구팀은 오미크론의 염기서열을 분석할 수 있었습니다. 그들은 최근에 그들의 연구 결과를 발표했습니다. 자가면역 저널.
“우리는 바이러스가 시간이 지남에 따라 진화하고 돌연변이를 획득한다는 것을 알고 있으므로 새로운 Omicron 변이에 대해 처음 들었을 때 이 변이에 특정한 돌연변이를 확인하고 싶었습니다.”라고 미주리 대학의 조교수인 Dr. Kamlendra Singh가 말했습니다. 분자 상호 작용 코어.
시퀀싱 오미크론
2021년 11월 26일까지 제공되는 오미크론 게놈 시퀀스를 사용하여 팀은 돌연변이를 식별하기 위해 처리했습니다. 그들은 분석한 서열의 50% 이상에서 발생하는 돌연변이를 선택하고 Omicron 변이체에 고유한 46개의 높은 유병률 돌연변이를 발견했습니다.
이 중 23개는 연구원들이 SARS-CoV-2 감염에 중요한 것으로 확인된 스파이크 단백질에 국한되었으며 mRNA 백신은 이를 표적으로 하는 항체를 생성하도록 설계되었습니다.
스파이크 단백질의 기존 모델을 사용하여 돌연변이가 Omicron이 면역을 회피하는 데 어떻게 도움이 될 수 있는지 조사하기 위해 항체와의 상호 작용을 모델링했습니다.
이들은 돌연변이의 위치가 항체의 결합 및 상호작용을 방해한다는 것을 보여주었다. “많은 돌연변이가 항체가 결합해야 하는 스파이크 단백질의 수용체 결합 도메인 위치에 있습니다.”라고 Singh 박사는 말했습니다. MNT 인터뷰에서.
“변이가 있다면 분명히 항체가 스파이크 단백질에 효과적으로 결합하지 못하고 예방 접종 및 사전 감염의 효능을 감소시킬 수 있다고 생각할 것입니다.”
처음에 오미크론 변이체가 어떻게 진화했는지 확인하는 데 관심이 있는 연구원들은 계통 발생 분석을 사용하여 각 변이체 Alpha, Beta, Gamma, Delta, Mu 및 Omicron의 서열을 매핑했습니다.
이 논문은 Omicron이 SARS-CoV-2의 감마 변종과 가장 밀접한 관련이 있다고 결론지었습니다.
아직까지 가장 큰 SARS-CoV-2 ‘진화적 도약’
연구에 참여하지 않은 글래스고 대학교의 진화 바이러스학자이자 박사 과정 후보자인 Spyros Lytras는 Omicron을 우리가 지금까지 본 SARS-CoV-2의 가장 큰 “진화적 도약”이라고 설명했습니다. 그는 또한 그것이 이전에 알려진 우려 변종의 “하위 분류군”이 아니라고 설명했습니다.
그는 연구 결과를 설명했다. 자가면역 저널 이메일로 종이 MNT: 논문은 “Omicron이 Gamma clade에서 진화했다고 주장하지 않습니다.”라고 Lytras는 말했습니다.
“그들이 말하는 것은 오미크론 계통군이 다른 계통군에 비해 감마 계통군과 더 최근의 공통 조상을 공유했다는 것입니다. [variants of concern] 클레이드. 그 오미크론/감마의 마지막 공통 조상은 당시 오미크론도 감마도 아니었다. 나무에서 Omicron clade의 배치를 볼 수 있기 때문에 이것은 뉴스가 아닙니다. [Nextstrain]SARS-CoV-2 트리를 탐색하기 위한 최고의 도구 중 하나입니다.”
그는 현재 인쇄 전 단계에 있는 자신의 연구 결과를 공개했는데, 이는 연구원들이 Omicron에서 발견한 돌연변이가 모두 함께 존재할 때만 바이러스에 유익한 것으로 보인다는 것을 시사합니다.
연구원은 “오미크론은 우리가 이전에 보았던 일부 면역 회피 돌연변이를 독자적으로 축적했지만 고유한 변화의 대부분이 스스로 면역을 회피할 것으로 예상되지는 않는다”고 말했다.
“그러나 오미크론 스파이크는 우리가 사전 인쇄에서 보여주듯이 순환하는 SARS-CoV-2 또는 SARS-CoV-2와 가장 밀접하게 관련된 박쥐 바이러스에서 이전에 볼 수 없었던 많은 변화를 가지고 있습니다.”
“예상되는 면역회피효과 […] 개별적으로 측정되기 때문에, 그 자체로 작은 항원 효과를 갖는 돌연변이가 함께 존재할 때 효과를 부가적으로 증가시킬 수 있습니다(Omicron에서와 같이).”라고 Lytras는 설명했습니다.
“단일 변이에 나타나는 이러한 모든 예상치 못한 변화에 대한 가장 가능성 있는 설명은 ‘긍정적 상위성(positive epistasis)’입니다. 즉, 이러한 변화는 바이러스에 이롭고 동시에 모두 존재할 때만 면역을 회피하거나 더 빠르게 전파합니다. .”
“전반적인, [Omicron] 함께 있을 때만 바이러스에 이로운 것처럼 보이는 많은 돌연변이가 축적되었으며, 대부분의 변화가 그 자체로 면역 회피를 크게 증가시키지 않는 것처럼 보이지만 함께 존재할 때 바이러스가 이전에 획득한 회피를 확실히 허용합니다. 지금 세계가 직면하고 있는 오미크론 파동에서 분명하듯이 어느 정도 면역성이 있습니다.”
– 스피로스 리트라스
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